3、符合初創(chuàng)期小企業(yè)創(chuàng)新項目的，申報一般創(chuàng)新項目不予受理。
(三) 重點創(chuàng)新項目
重點創(chuàng)新項目圍繞每年度國家經(jīng)濟發(fā)展領域（產(chǎn)業(yè)、行業(yè)）的重點需求，選擇對產(chǎn)業(yè)和行業(yè)有影響、帶動作用的關鍵技術和關鍵創(chuàng)新產(chǎn)品作為突破口，給予具有較高成長性的科技型中小企業(yè)重點支持的項目。
2009年重點創(chuàng)新項目繼續(xù)體現(xiàn)科學發(fā)展觀和構建和諧社會的要求，注重解決當前市場急需和產(chǎn)業(yè)升級的關鍵技術問題，加大對國家十大重點振興產(chǎn)業(yè)尤其是紡織輕工等行業(yè)具有帶動作用的關鍵技術、關鍵創(chuàng)新產(chǎn)品的支持；加強對能源、資源、環(huán)境、衛(wèi)生健康、公共安全等領域關鍵技術創(chuàng)新的支持；加快推進科技創(chuàng)新成果的市場轉化，尤其是前瞻性、戰(zhàn)略性產(chǎn)業(yè)項目的培育；必須符合科技部創(chuàng)新基金《指南》的支持方向和范圍，對于《指南》中明確提出的“本年度重點創(chuàng)新項目優(yōu)先支持的內(nèi)容”給予優(yōu)先支持。
重點創(chuàng)新項目采用無償資助方式，由北京市直接推薦到科技部創(chuàng)新基金管理中心，采取先行申報后立項支持的方式，對于在國家立項的重點創(chuàng)新項目，組織單位給予不低于創(chuàng)新基金支持數(shù)額60%的資金支持。
重點創(chuàng)新項目的申報條件：
1. 企業(yè)職工人數(shù)不超過500人；年營業(yè)收入不超過30000萬元；資產(chǎn)總額不超過30000萬元；至少有三年的運營時間。
2. 符合《項目指南》規(guī)定的支持方向，其中符合重點創(chuàng)新項目支持方向優(yōu)先；項目技術領域是國家及地方重點或急需發(fā)展的領域，與產(chǎn)業(yè)或行業(yè)關聯(lián)度很大，對產(chǎn)業(yè)或行業(yè)的發(fā)展影響較大；
3. 技術含量高，創(chuàng)新性強，有自主知識產(chǎn)權，優(yōu)先支持已獲得發(fā)明專利的項目；
4. 企業(yè)具有較高的成長性，3年的營業(yè)收入增長率不低于150%，最近一年的營業(yè)收入增長率不低于50%，加權平均凈資產(chǎn)收益率不低于10%，在被分析的三個年度中，第一年企業(yè)營業(yè)收入不少于1000萬元；
（2009年申報企業(yè)3年的銷售收入增長率=（2008年度企業(yè)銷售收入-2006年度企業(yè)銷售收入）÷2006年企業(yè)銷售收入×100 %；加權平均凈資產(chǎn)收益率=2008年度凈利潤÷2008年度平均凈資產(chǎn)×100%）
5. 市場前景好、經(jīng)濟社會效益顯著，有較大的影響力和顯示度；
6. 企業(yè)已獲得過創(chuàng)新基金支持，且項目驗收合格；已獲得過創(chuàng)業(yè)投資或風險投資的優(yōu)先支持。
7．企業(yè)需提交經(jīng)會計師事務所（或?qū)徲嫀熓聞账徲嫷钠髽I(yè)2006年度、2007年度、2008年度的會計報表和相應的審計報告（含會計師事務所營業(yè)執(zhí)照、注冊會計師證書的復印件），申報前最近一個月的會計報表。
未列入重點創(chuàng)新項目支持的，不作為一般項目立項。
(四) 合作基金（僅限中關村管委會）